云南省地处祖国西南边陲，与缅甸、老挝、越南三国接壤，边境线长达4060公里。由于境外疟疾、登革热等传染病高发，边民往来频繁，给云南省防范境外传染病传入带来巨大压力。2011年原卫生部与云南省人民政府签署《加快云南卫生桥头堡建设战略合作协议》，云南省以项目为依托，以边境地区为重点，加强与周边国家信息交流与合作，逐步建立起边境地区重点传染病防控屏障。主要做法如下：
　　一是积极争取经费投入。2002年至2013年，云南省通过在边境地区实施全球基金疟疾防控项目，每年争取投入2500—3000余万元疟疾防控经费，初步建立了中缅边境疟疾防护屏障，有效推进了消除疟疾工作的进程。2010年以来，国家卫计委将边境登革热防控列为传染病防控工作的重点，开展了中国云南与周边国家边境地区疟疾/登革热联防联控试点项目。
　　二是加强与周边国家的交流与合作。2011年以来，云南省先后与老挝七省卫生厅举行了边境地区疟疾和登革热联防联控研讨会，形成了疫情信息及其防治成果共享机制。2012年，邀请老挝北部五省卫生厅厅长及疾控中心代表等参加了云南省边境地区登革热输入疫情应急处置演练观摩，2013年6月邀请老挝南塔省卫生厅联合开展了勐腊登革热输入疫情应急处置演练， 2013年、2014年，中老双方在勐腊磨憨口岸联合举办了“4.25国际疟疾日”宣传活动。
　　三是逐步建立边境地区跨境联防联控机制。2002年以来，在全球基金疟疾项目支持下，云南省在边境地区建立了68个疟疾防治咨询服务站，在缅甸边境地区建立了80个疟疾防治咨询服务站。通过建立完善边境登革热监测预警、疫情处置联防联控机制，有效阻止了境外大量登革热病例输入。
　　四是制定完善防控技术方案。云南省结合防控工作实际，先后制定了《云南省边境地区疟疾防护暂行办法》、《云南省边境地区及流动人口疟疾防治方案》、《云南省消除疟疾计划（2010—2020年）实施方案》，《云南省登革热疫情处置预案》、《云南省边境地区登革热防控方案》等。通过制定完善相关防控方案，为边境地区开展消除疟疾和登革热防控提供了科学依据。
　　五是加强防控技术科学研究。2014年，中国疾控中心在西双版纳州、德宏州成立了登革热和热带病工作站，重点开展边境地区登革热的诊断、媒介控制和疫情处置的技术评价。2007—2012年云南省在边境地区开展和完成了国家疟疾重大科技专项研究，以科研成果提升疟疾、登革热防控水平。